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同源四倍体鱼和二倍体红鲫卵巢转录组特性分析

日期:2019年02月27日 浏览数:

   多倍化能够显著地改变动物的生殖特性,包括配子的大小等特性,然而其分子机制知之甚少。省部共建淡水鱼类发育生物学国家重点实验室刘少军教授研究团队长期以来从事鱼类远缘杂交研究,经过十多年鲫鲂远缘杂交研究,在世界上首次建立了来源于双亲染色体数不同的同源四倍体鱼品系,目前该品系已经稳定繁殖到第14代。在遗传组成方面,该同源四倍体鱼含有来自于红鲫四套染色体组;在外形方面,与红鲫有显著差异;然而在生殖特性方面,虽然这两种鱼都是一年可性成熟,但是同源四倍体鱼产生的二倍体卵子明显大于二倍体红鲫产生的单倍体卵子。为了在分子水平上探究这两种鱼在卵巢及卵子方面的差异性,该研究团队对同源四倍体鱼和红鲫的卵巢组织转录组进行了比较分析研究,鉴定出19,015个差异表达基因。对比分析结果表明同源四倍体鱼中有12,591个基因表达量上调,6,424个基因表达量下调;预测CDKL1,AHCY,ARHGEF3,TGFβ,WNT11, CYP27A, GDF7CKB八个基因与卵子大小有关,参与了调控细胞增殖,细胞分裂,基因转录,卵巢发育以及能量代谢;用荧光定量PCR方法验证了这8个基因表达水平。

   相关研究结果近日以“Transcriptome Profile Analysis on Ovarian Tissues of Autotetraploid Fish and Diploid Red Crucian Carp”为题,发表在Frontiers in Genetics上。该文第一作者为王余德博士,通讯作者为刘少军教授。

 

 

图1红鲫和同源四倍体鱼卵巢结构及卵子大小比较图 

A.红鲫卵巢结构;B.同源四倍体卵巢结构;

C.红鲫卵子;D.同源四倍体卵子

图2.卵子大小相关基因荧光定量PCR结果图

(A)WNT11; (B)CDKL1; (C)AHCY; (D)ARHGEF3(GEF)3; (E)TGFβ; (F)CYP27A;

(G)CKB(H)GDF7; 在每个面板中,4n表示同源四倍体鱼,2n表示二倍体红鲫;不同小写字母表示差异有统计学意义(p<0 .05)

 

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