鱼类健康养殖：研究优良鱼类新品种的健康养殖模式。
1、养殖水体和鱼类肠道微生物组研究
研究源于远缘杂交的优良鱼类品种和对照组在不同养殖条件下，水体中的微生物结构和类群的变化规律；鉴定出调节其生长发育的有益微生物组和致病微生物组；研究病原菌对鱼类致病的作用机制和防治技术；形成增加水体有益微生物、控制鱼类病害发生的健康养殖模式。
研究源于远缘杂交的优良鱼类品种和对照组在不同生长时期的肠道微生物组的种类和数量分布，鉴定出具有重要作用的优势微生物组，并对有关重要酶类和小分子活性物质进行研究，探讨这些活性分子对鱼类抗病性的调控机制，研制微生态制剂，为鱼类健康生长发育提供理论基础。
2、鱼类免疫与营养代谢研究
基于源于远缘杂交的优良鱼类品种已有的抗病优势，系统研究其抗GCRV（草鱼呼肠孤病毒）、SVCV（鲤春病毒血症病毒）和KHV（锦鲤疱疹病毒）等病毒的天然免疫分子机制，为优良鱼类品种的健康养殖提供免疫学方面的理论基础。
研究源于远缘杂交的优良鱼类品种的生长发育与营养需求关系，根据其高产的营养代谢特点，研制促进营养代谢的饲料添加剂，为优良鱼类品种的健康养殖提供理论基础。
