红鲫是一种具有鲜艳橙色的观赏鱼，研究发现其在幼鱼体色发育过程中存在一个青灰色转变为红色体色的体色形成过程。在我们的研究中，针对红鲫体色发育的三个不同阶段得到青灰色、体色转变中和红色体色这三个皮肤组织样品并进行转录组分析。结果显示差异表达基因富集在多条色素合成相关的信号通路中，如黑色素合成相关基因（Mitf, Pax3, Foxd3, Mc1r, Asip），酪氨酸代谢相关基因（Tyr, Dct, Tyrp1, Tat, Hpda）以及蝶啶代谢相关基因（Gch, Xdh, Ptps, Tc）。其中，Mitfa作为一个主要的参与黑色素合成与调控基因，mitfa通过调控Tyr, Tyrp1, Dct, Tfe3a and Baxα的表达，在红鲫青灰色转变为红色体色转变过程中发挥着重要作用。此外，转录组学研究表明，细胞凋亡与细胞自噬通路相关基因，如Tfe3a, Baxα, Hsp70, Beclin1, Lc3, Atg9a, Atg4a等可能参与了红鲫幼鱼黑色素细胞的消退过程。相关研究结果增进了对红鲫体色形成机制的了解，也为观赏鱼品种的培育及遗传改良奠定了理论基础。
该研究成果近日以“Comparative transcriptome analysis of molecular mechanism underlying gray-to-red body color formation in red crucian carp (Carassius auratus, red var.)”为题，发表在Fish Physiol Biochem (2017, doi:10.1007/s10695-017-0379-7)。该文第一作者为张永勤博士，通讯作者为肖亚梅教授和刘文彬教授。
Comparative transcriptome analysis of molecular mechanism underlying gray-to-red body color formation in red crucian carp (Carassius auratus, red var.).pdf
